Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP21Q9UK80 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms