Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms