Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFMBT1Q9UHJ3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SFMBT1Q9UHJ3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms