Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO40Q9UH90 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO40Q9UH90 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms