Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOBEC3BQ9UH17 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOBEC3BQ9UH17 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms