Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP3AQ9UFN0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP3AQ9UFN0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP3AQ9UFN0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP3AQ9UFN0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP3AQ9UFN0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NIPSNAP3AQ9UFN0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms