Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP2Q9UDT6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms