Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DBF4Q9UBU7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DBF4Q9UBU7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms