Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG4Q9UBN1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG4Q9UBN1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG4Q9UBN1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 465.2 ms