Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRR3Q9UBC9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRR3Q9UBC9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms