Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMD4AQ9P2Q2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMD4AQ9P2Q2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FRMD4AQ9P2Q2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FRMD4AQ9P2Q2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMD4AQ9P2Q2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMD4AQ9P2Q2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FRMD4AQ9P2Q2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FRMD4AQ9P2Q2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMD4AQ9P2Q2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMD4AQ9P2Q2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms