Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RCOR3Q9P2K3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCOR3Q9P2K3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms