Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SH3BP4Q9P0V3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4Q9P0V3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
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