Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM53CQ9NYF3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM53CQ9NYF3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms