Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDND1Q9NY35 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDND1Q9NY35 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms