Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MS4A12Q9NXJ0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms