Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TOR4AQ9NXH8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOR4AQ9NXH8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOR4AQ9NXH8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOR4AQ9NXH8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOR4AQ9NXH8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOR4AQ9NXH8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOR4AQ9NXH8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOR4AQ9NXH8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TOR4AQ9NXH8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOR4AQ9NXH8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOR4AQ9NXH8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOR4AQ9NXH8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOR4AQ9NXH8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TOR4AQ9NXH8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOR4AQ9NXH8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOR4AQ9NXH8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOR4AQ9NXH8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOR4AQ9NXH8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TOR4AQ9NXH8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TOR4AQ9NXH8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOR4AQ9NXH8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms