Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CWC25Q9NXE8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CWC25Q9NXE8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms