Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR3EQ9NVU0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR3EQ9NVU0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.4 ms