Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMILIN3Q9NT22 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EMILIN3Q9NT22 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms