Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMSN1Q9NSI8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms