Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
FARSBQ9NSD9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FARSBQ9NSD9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms