Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM7SF3Q9NS93 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms