Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TOPORSQ9NS56 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOPORSQ9NS56 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms