Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS4Q9NRS4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS4Q9NRS4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms