Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPTBN5Q9NRC6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPTBN5Q9NRC6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms