Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDLIM7Q9NR12 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDLIM7Q9NR12 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDLIM7Q9NR12 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms