Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms