Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VTA1Q9NP79 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms