Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRMS1Q9HCU9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms