Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C11orf49Q9H6J7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms