Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LHX5Q9H2C1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX5Q9H2C1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms