Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDGFDQ9GZP0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDGFDQ9GZP0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms