Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
BCL11BQ9C0K0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BCL11BQ9C0K0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms