Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CIPCQ9C0C6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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