Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM7Q9C029 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM7Q9C029 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM7Q9C029 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms