Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF3BQ9BZI7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
UPF3BQ9BZI7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF3BQ9BZI7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms