Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
SALL3Q9BXA9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms