Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC106Q9BWC9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC106Q9BWC9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC106Q9BWC9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC106Q9BWC9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC106Q9BWC9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC106Q9BWC9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC106Q9BWC9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC106Q9BWC9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC106Q9BWC9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC106Q9BWC9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC106Q9BWC9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC106Q9BWC9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms