Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MKNK1Q9BUB5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKNK1Q9BUB5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms