Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNPY3Q9BT09 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPY3Q9BT09 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms