Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms