Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MESP1Q9BRJ9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms