Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SGIP1Q9BQI5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SGIP1Q9BQI5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms