Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRQ99707 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRQ99707 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRQ99707 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRQ99707 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRQ99707 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRQ99707 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRQ99707 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRQ99707 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRQ99707 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRQ99707 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRQ99707 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRQ99707 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRQ99707 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRQ99707 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRQ99707 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRQ99707 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRQ99707 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRQ99707 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRQ99707 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRQ99707 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRQ99707 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRQ99707 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRQ99707 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRQ99707 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRQ99707 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRQ99707 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRQ99707 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRQ99707 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRQ99707 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRQ99707 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRQ99707 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRQ99707 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRQ99707 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRQ99707 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRQ99707 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRQ99707 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRQ99707 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRQ99707 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRQ99707 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRQ99707 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRQ99707 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRQ99707 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRQ99707 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRQ99707 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRQ99707 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRQ99707 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRQ99707 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRQ99707 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRQ99707 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRQ99707 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRQ99707 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRQ99707 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRQ99707 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRQ99707 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRQ99707 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRQ99707 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRQ99707 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRQ99707 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRQ99707 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRQ99707 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRQ99707 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRQ99707 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MTRQ99707 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MTRQ99707 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRQ99707 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRQ99707 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRQ99707 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRQ99707 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRQ99707 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRQ99707 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRQ99707 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRQ99707 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRQ99707 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRQ99707 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRQ99707 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRQ99707 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRQ99707 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRQ99707 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRQ99707 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRQ99707 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRQ99707 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRQ99707 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRQ99707 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRQ99707 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRQ99707 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRQ99707 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRQ99707 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRQ99707 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRQ99707 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRQ99707 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRQ99707 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRQ99707 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRQ99707 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms