Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHP1Q99653 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHP1Q99653 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms