Protein–RNA interactions for Protein: Q99626

CDX2, Homeobox protein CDX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDX2Q99626 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDX2Q99626 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms