Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3CQ99613 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms