Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SIN3AQ96ST3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SIN3AQ96ST3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms