Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CSRNP1Q96S65 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms